質(zhì)粒上的復制起點屬于低拷貝型
質(zhì)粒的拷貝數(shù)是由質(zhì)粒上的復制起點決定的,有的復制起始點屬于低拷貝型。請確認質(zhì)粒上復制起點類型。對于低拷貝質(zhì)粒,則需要擴大細菌培養(yǎng)量以獲得足夠的質(zhì)粒DNA。
進一步了解不同載體復制起點的拷貝數(shù)
用于質(zhì)粒提取的菌量過少
請檢查確認質(zhì)粒制備柱的結(jié)合容量以及您的質(zhì)粒是高拷貝還是低拷貝質(zhì)粒。對于小量提取,我們建議您收集1-5 ml過夜培養(yǎng)菌液。對于大量提取,如果質(zhì)粒是高拷貝,我們推薦使用100-150 ml過夜培養(yǎng)菌液;如果是低拷貝,我們推薦使用300-500 ml過夜培養(yǎng)菌液。一般情況下,對于高拷貝質(zhì)粒,1 ml的過夜培養(yǎng)菌液可以小量提取約5 ug的質(zhì)粒DNA,150 ml的過夜培養(yǎng)菌液可以提取約500 ug的質(zhì)粒DNA;對于低拷貝質(zhì)粒(如pET),1 ml過夜培養(yǎng)菌液可以小量提取1.5-2.5 ug質(zhì)粒DNA,150 ml過夜培養(yǎng)菌液可以提取150-200 ug質(zhì)粒DNA。
只有小部分菌體含有質(zhì)粒
有的抗生素,尤其是氨芐青霉素,在液體培養(yǎng)中會快速降解,導致不含質(zhì)粒的細菌可以大量繁殖,最終使得質(zhì)粒制備產(chǎn)量低。為了避免這種情況,請在使用前新鮮制備含氨芐青霉素的生長培養(yǎng)基,并確保提供足夠的濃度。另外,在培養(yǎng)具有氨芐抗性的細菌時,請不要讓菌液飽和培養(yǎng)時間過長。因為隨著培養(yǎng)時間的增加,培養(yǎng)基的抗生素會越來越少,許多細菌細胞也已死亡且它們所含的質(zhì)粒DNA會被降解,所以從過飽和培養(yǎng)的菌液中提取的質(zhì)粒DNA產(chǎn)量會低。請從新鮮菌液提取質(zhì)粒DNA,如果不能立即進行質(zhì)粒制備,則可以將菌體離心沉淀,并儲存于-80°C冰箱中備用。
直接取甘油菌進行接菌培養(yǎng)
直接將接收到的甘油菌或穿刺菌進行接種,可能會偶爾出現(xiàn)質(zhì)粒制備產(chǎn)量低的情況。我們建議先在含有適當抗生素的LB平板上劃線,然后挑取單菌落接種到含有相應抗生素的新鮮液體培養(yǎng)基中。具體操作說明請在菜單欄“資源中心>說明書/MSDS>甘油菌”進行查看。
沒有正確使用質(zhì)粒提取試劑盒
請在使用前仔細閱讀質(zhì)粒制備試劑盒使用說明書,防止不當操作。
質(zhì)粒制備柱質(zhì)量較差
某些品牌的質(zhì)粒DNA制備柱質(zhì)量較差,請及時檢測更換相應試劑盒。