熒光蛋白，螢光素酶和LacZ都是基于重組蛋白的報(bào)告基因，可以用于定位或成像研究。然而，這幾類蛋白各有不同，適用于不同的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。

熒光蛋白和螢光素酶都屬于發(fā)光蛋白，可用照相機(jī)或類似的裝置來檢測熒光表達(dá)。熒光蛋白通過吸收一種顏色的光（激發(fā)），然后發(fā)出不同顏色（發(fā)射）的較低能量光來起作用。相反，螢光素酶（和其他生物發(fā)光酶）通過催化底物（即螢光素）發(fā)生化學(xué)反應(yīng)而發(fā)光。

熒光蛋白比螢光素酶明亮得多，這有利于將其應(yīng)用到許多不同類型的實(shí)驗(yàn)中。但是，在組織樣品或活體動物中，背景、自發(fā)熒光和光散射等問題可能會影響熒光的觀察。熒光素酶的活性分析需要螢光素，所以在分析之前必須將該底物加入培養(yǎng)基或注射到活體動物體內(nèi)。與熒光蛋白相比，這可能會影響實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性或定量。

與上述兩種標(biāo)記不同，LacZ不發(fā)光。相反，LacZ基因的產(chǎn)物β-半乳糖苷酶可以催化X-gal轉(zhuǎn)化成類似于靛藍(lán)的不透明藍(lán)色化合物。為了使LacZ可視化，首先必須將樣品用X-gal溶液染色，且該染色步驟與活體樣品觀察不兼容。盡管高度敏感，但LacZ/X-gal染色是非定量的，并且不能提供類似熒光或生物發(fā)光蛋白的高分辨率。

通常情況下，我們建議LacZ用于整體胚胎或組織切片的基因表達(dá)研究。對于活體動物研究來說，熒光或生物發(fā)光可能是更好的選擇，但也跟多種因素有關(guān)，如是否需要對內(nèi)部深層組織進(jìn)行成像以及是否存在標(biāo)記亮度問題。