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如何計(jì)算gRNA特異性分值?

我們使用的gRNA設(shè)計(jì)和評分使用了 CRISPR文庫設(shè)計(jì)(CLD)中的規(guī)則。簡而言之,對于每個(gè)物種,我們找出符合N(20)NGG規(guī)則的靶序列,把錯(cuò)配堿基≤3的序列列為潛在的脫靶位點(diǎn),計(jì)算出每個(gè)gRNA的脫靶分值,進(jìn)而得出最終的gRNA特異性分值。gRNA特異性分值在0-100之間,分值越大靶向特異性越高。

請注意特異性分值只是一個(gè)參考值。實(shí)際的靶向效率和特異性可能會(huì)與預(yù)測的分值有偏差,低分值的gRNA也可能有較好的靶向效果。

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