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載體構建

在分子生物學中,載體是一種可以攜帶外源核酸序列進入靶細胞中的物質(zhì),有質(zhì)粒DNA載體、人工染色體載體、病毒載體等多種形式?;蚬こ套畛J褂玫妮d體是質(zhì)粒DNA載體,通常包含復制起點、啟動子、篩選標記等多種載體元件。構建質(zhì)粒DNA載體的目的即是要將外源DNA片段插入到質(zhì)粒骨架上。該質(zhì)??梢栽谒拗骶凶晕覐椭?,并且在一些情形下進一步用于下游的細胞轉(zhuǎn)染或者病毒包裝等實驗,從而實現(xiàn)外源DNA在靶細胞中的表達。

傳統(tǒng)實驗室方法構建含有目的基因的重組質(zhì)粒DNA載體一般采用酶切連接法,其操作流程概括如下:

1、用一定量的DNA限制性內(nèi)切酶切割質(zhì)粒,使質(zhì)粒出現(xiàn)缺口,切口處的黏性末端暴露;
2、再用DNA限制性內(nèi)切酶處理目的基因的DNA片段,使其產(chǎn)生對應的黏性末端;
3、將處理好目的基因片段以與切割好的質(zhì)粒混合。目的基因片段的黏性末端和質(zhì)粒切口的黏性末端互補配對;
4、再加入適量的DNA連接酶,催化目的基因片段和質(zhì)粒DNA鏈之間形成磷酸二酯鍵,從而將相鄰的脫氧核糖核酸連接起來,形成一個重組質(zhì)粒DNA分子。
5. 重組質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)化大腸桿菌并擴增,然后篩選轉(zhuǎn)化后的克隆并驗證目的基因的連接效果。

對比效率較低的酶切連接法,云舟生物可使用多種高通量策略進行載體克隆。在我們的高度優(yōu)化的克隆平臺上,一般的表達載體我們使用Gateway克隆和Gibson組裝等方式構建,而shRNA和gRNA載體則使用基于直接連接的方式快速構建。此外,根據(jù)具體項目的需要,我們也可以使用從頭基因合成、Golden Gate等方式構建載體。

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